Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A2Q01362 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms