Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vamp3P63024 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms