Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SIK1P57059 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIK1P57059 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIK1P57059 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIK1P57059 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIK1P57059 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIK1P57059 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIK1P57059 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK1P57059 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK1P57059 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK1P57059 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK1P57059 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK1P57059 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK1P57059 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK1P57059 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK1P57059 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK1P57059 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK1P57059 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK1P57059 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK1P57059 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK1P57059 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK1P57059 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK1P57059 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK1P57059 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIK1P57059 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIK1P57059 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK1P57059 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK1P57059 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK1P57059 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK1P57059 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK1P57059 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK1P57059 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK1P57059 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK1P57059 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK1P57059 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK1P57059 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK1P57059 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK1P57059 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIK1P57059 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK1P57059 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms