Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP98P52948 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP98P52948 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP98P52948 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP98P52948 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP98P52948 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP98P52948 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP98P52948 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP98P52948 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP98P52948 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP98P52948 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP98P52948 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP98P52948 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP98P52948 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP98P52948 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP98P52948 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP98P52948 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP98P52948 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP98P52948 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP98P52948 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP98P52948 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP98P52948 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP98P52948 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP98P52948 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP98P52948 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP98P52948 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP98P52948 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP98P52948 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP98P52948 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP98P52948 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP98P52948 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP98P52948 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP98P52948 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP98P52948 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP98P52948 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP98P52948 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP98P52948 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP98P52948 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP98P52948 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP98P52948 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP98P52948 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP98P52948 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP98P52948 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP98P52948 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP98P52948 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms