Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCAP28676 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GCAP28676 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
GCAP28676 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GCAP28676 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCAP28676 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCAP28676 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCAP28676 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCAP28676 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCAP28676 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCAP28676 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCAP28676 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCAP28676 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCAP28676 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCAP28676 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCAP28676 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCAP28676 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCAP28676 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCAP28676 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCAP28676 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCAP28676 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCAP28676 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCAP28676 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCAP28676 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCAP28676 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCAP28676 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GCAP28676 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms