Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FGFR4P22455 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms