Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NF1P21359 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NF1P21359 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NF1P21359 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NF1P21359 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NF1P21359 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NF1P21359 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms