Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms