Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF1RP07333 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms