Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVV-1B6SEH8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-1B6SEH8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms