Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EFCAB5A4FU69 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EFCAB5A4FU69 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EFCAB5A4FU69 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EFCAB5A4FU69 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EFCAB5A4FU69 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EFCAB5A4FU69 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EFCAB5A4FU69 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EFCAB5A4FU69 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EFCAB5A4FU69 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EFCAB5A4FU69 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EFCAB5A4FU69 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EFCAB5A4FU69 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EFCAB5A4FU69 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EFCAB5A4FU69 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
EFCAB5A4FU69 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EFCAB5A4FU69 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EFCAB5A4FU69 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms