Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms