Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms