Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms