Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL4Q9UJQ4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL4Q9UJQ4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL4Q9UJQ4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL4Q9UJQ4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL4Q9UJQ4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL4Q9UJQ4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL4Q9UJQ4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL4Q9UJQ4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL4Q9UJQ4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL4Q9UJQ4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL4Q9UJQ4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms