Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms