Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
COPS7AQ9UBW8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS7AQ9UBW8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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