Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
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