Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BSDC1Q9NW68 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSDC1Q9NW68 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms