Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUOX1Q9NRD9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms