Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCSER1Q9C0I3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCSER1Q9C0I3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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