Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FYCO1Q9BQS8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms