Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms