Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms