Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHFRQ96EP1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHFRQ96EP1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHFRQ96EP1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHFRQ96EP1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHFRQ96EP1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHFRQ96EP1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHFRQ96EP1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHFRQ96EP1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHFRQ96EP1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHFRQ96EP1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHFRQ96EP1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHFRQ96EP1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms