Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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UBXN4Q92575 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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