Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL22A1Q8NFW1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL22A1Q8NFW1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL22A1Q8NFW1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL22A1Q8NFW1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL22A1Q8NFW1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL22A1Q8NFW1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL22A1Q8NFW1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL22A1Q8NFW1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL22A1Q8NFW1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL22A1Q8NFW1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL22A1Q8NFW1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL22A1Q8NFW1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL22A1Q8NFW1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL22A1Q8NFW1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL22A1Q8NFW1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COL22A1Q8NFW1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL22A1Q8NFW1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL22A1Q8NFW1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL22A1Q8NFW1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COL22A1Q8NFW1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COL22A1Q8NFW1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL22A1Q8NFW1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL22A1Q8NFW1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL22A1Q8NFW1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms