Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTC21AQ8NDW8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC21AQ8NDW8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms