Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME9Q86XW9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME9Q86XW9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms