Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDXQ7Z353 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDXQ7Z353 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms