Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms