Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGEF3Q5TH69 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms