Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms