Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEND3Q5T5X7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms