Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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