Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms