Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RFX7Q2KHR2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms