Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PMCHL1Q16048 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PMCHL1Q16048 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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