Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIX1Q15475 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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