Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUM3Q15397 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PUM3Q15397 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
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