Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPD2Q15021 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms