Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIXQ14938 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIXQ14938 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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