Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CBX2Q14781 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CBX2Q14781 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CBX2Q14781 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CBX2Q14781 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CBX2Q14781 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CBX2Q14781 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CBX2Q14781 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CBX2Q14781 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX2Q14781 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms