Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCINQ13939 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCINQ13939 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCINQ13939 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CCINQ13939 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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CCINQ13939 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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CCINQ13939 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCINQ13939 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCINQ13939 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCINQ13939 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCINQ13939 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCINQ13939 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCINQ13939 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCINQ13939 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCINQ13939 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCINQ13939 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCINQ13939 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCINQ13939 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCINQ13939 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCINQ13939 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCINQ13939 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCINQ13939 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCINQ13939 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCINQ13939 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCINQ13939 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCINQ13939 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCINQ13939 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCINQ13939 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCINQ13939 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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