Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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