Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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CDH18Q13634 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDH18Q13634 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CDH18Q13634 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CDH18Q13634 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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CDH18Q13634 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDH18Q13634 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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