Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCIRG1Q13488 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCIRG1Q13488 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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