Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DNMT1P26358 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNMT1P26358 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms