Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSSP25774 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSSP25774 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTSSP25774 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTSSP25774 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTSSP25774 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSSP25774 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSSP25774 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms