Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YY1P25490 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YY1P25490 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YY1P25490 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YY1P25490 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YY1P25490 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YY1P25490 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YY1P25490 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
YY1P25490 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YY1P25490 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YY1P25490 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YY1P25490 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YY1P25490 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
YY1P25490 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YY1P25490 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YY1P25490 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YY1P25490 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YY1P25490 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YY1P25490 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YY1P25490 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YY1P25490 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YY1P25490 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YY1P25490 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YY1P25490 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YY1P25490 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YY1P25490 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YY1P25490 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YY1P25490 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YY1P25490 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YY1P25490 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YY1P25490 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YY1P25490 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YY1P25490 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YY1P25490 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YY1P25490 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YY1P25490 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YY1P25490 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YY1P25490 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YY1P25490 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YY1P25490 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YY1P25490 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YY1P25490 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YY1P25490 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YY1P25490 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YY1P25490 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YY1P25490 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YY1P25490 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YY1P25490 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YY1P25490 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YY1P25490 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YY1P25490 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YY1P25490 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YY1P25490 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YY1P25490 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YY1P25490 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YY1P25490 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YY1P25490 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YY1P25490 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YY1P25490 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YY1P25490 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YY1P25490 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YY1P25490 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YY1P25490 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YY1P25490 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YY1P25490 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
YY1P25490 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
YY1P25490 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YY1P25490 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YY1P25490 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YY1P25490 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
YY1P25490 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YY1P25490 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YY1P25490 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YY1P25490 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YY1P25490 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms